Die häufigsten Indikationen für eine Hornhauttransplantation sind bullöse Keratopathie (pseudophakisch, Fuchs-Endotheldystrophie, aphakisch), Keratokonus, Gewebetransplantation, Keratitis (viral, bakteriell, fungal, Acanthamoeba, Perforation) und stromale Hornhautdystrophien.