Der Erreger der durch Zecken übertragenen viralen Enzephalitis gehört zur Gattung der Flaviviren. Das Virion hat eine sphärische Form, einen Durchmesser von 40-50 nm, enthält RNA, reproduziert sich gut in vielen Gewebekulturen. Von Labortieren sind weiße Mäuse, Hamster, Affen, Baumwollratten am empfindlichsten für das Virus. Anfällig gegen durch Zecken übertragenes Enzephalitis-Virus und viele Haustiere.