Die Bestimmung des X- und Y-Chromatins wird häufig als schnelle Methode zur Geschlechtsbestimmung bezeichnet. Dabei werden Zellen der Mundschleimhaut, des Vaginalepithels oder der Haarfollikel untersucht. Die Zellkerne weiblicher Zellen enthalten zwei diploide X-Chromosomen, von denen eines bereits in frühen Stadien der Embryonalentwicklung vollständig inaktiviert (aufgewickelt und dicht gepackt) ist und als Heterochromatin-Klumpen an der Kernmembran sichtbar ist.