Die funktionelle MRT basiert auf einem erhöhten Blutfluss im Gehirn als Reaktion auf eine Zunahme der neuronalen Aktivität des Kortex unter der Wirkung des entsprechenden Stimulus. Die Kartierung der Gehirnaktivität ermöglicht es uns, Bereiche der neuronalen Aktivierung zu identifizieren, die als Reaktion auf Stimulation (motorische, sensorische und andere Reize) auftreten.